查询客户公司是小规模纳税人还是一般纳税人，可以直接查询企业税务登记证，其中会标明该企业是小规模纳税人还是一般纳税人。有需要索取税务登记证等证明文件的，可以联系公司税务登记部门。除此之外，还可以利用国税总局网站上的客户缴税查询系统来查询纳税人识别号和税种，从而判断客户公司是小规模纳税人还是一般纳税人。拓展知识：小规模纳税人是指按照《中华人民共和国企业所得税法》第三十八条的规定的企业所得税的实行小规模纳税人政策的纳税人。一般纳税人指不记入小规模纳税人的其他纳税人。