1. 公司缴纳增值税的分录如下：从应交税费科目借方100元，贷方增值税应交款科目100元。 2. 附加税缴纳的分录如下：从应交税费科目借方100元，贷方附加税应交款科目100元。 3. 公司缴纳增值税和缴纳附加税都是由纳税人自行缴纳的，因此在记账时应该将其网上支付的金额直接划入应交税费科目，当然也需要对照上传税务局的相关资料进行核对。具体的记账形式，可以根据企业的具体情况视情况而定。