是的，在申报个税时，要将公司承担的个人社保费用也计入员工收入里申报个税。根据国家规定，从2020年1月1日起，全国地方税务部门实施将收取社会保险费后的个人收入纳入当期个税累计金额计算体系，实施个人所得税改革。根据新的规定，当月的工资收入和养老、医疗、失业等基本养老保险缴费额，均计入当月的个税累计金额，累计金额决定个人当月应纳税额，从而促进劳动者受益。此外，公民还可以每月缴纳自己的住房公积金，缴费超过个人部分的住房公积金也可以减免税。