A公司与B公司之间的付款流程应包括：一、双方签订相关的货款协议，协议包括支付的金额、支付的方式、支付的时间等内容。二、A公司向银行提交付款申请，申请付款时需提供付款协议、付款凭证或相关凭证等资料，包括A公司授权付款方B公司信息。三、A公司付款时需要提供有效的支付凭证，以便银行支付B公司相应的货款。四、B公司收到货款时需要准备收款单，以便A公司可以查看收款情况，完成付款结算。 此外，在付款前， A公司可以采取一些额外的措施以验证有关的货物或服务的交付情况，比如与B公司签订三方协议，要求B公司提供详细的货物或服务交付情况等。