建筑工程合同申报印花税一般按次申报，也就是说完成一次工程的合同后就需要缴纳印花税。拓展知识：根据《中华人民共和国印花税暂行条例》规定，房地产、矿产、海关进出口关税以及金融、保险、建筑工程等各类合同申报印花税费时，合同金额全额应税，每次买卖行为均需缴纳印花税。示例：某建筑工程公司获得一笔建筑工程合同，协议金额为100万元，完成合同后，该公司需要支付10000元的印花税。