根据《中华人民共和国企业所得税法实施条例》第八十五条的规定，有进项发票没有找到，企业可以凭其他有效的证明文件如购货合同、运输发票、收据等进行抵扣，且必须有盖公章的书面证明。如果缴税人经查证发现其进项金额及税额有明显异议，可以暂停进项抵扣。示例：上月，李文公司收到一张发票，缴税人凭这张发票申报所得税，但是没过几天，李文公司发现这张发票消失了，但是李文拥有一份购货合同，对发票进行抵扣。