如果员工没有填写专项附加扣除，单位可以在个税系统中帮助他们填写，但需要具体缴纳单位根据不同情况有不同的要求，比如需要准备原件材料，申报人姓名，关系等信息，以及报销金额，时间等，并根据实际情况复核以确保信息的准确无误。拓展知识：专项附加扣除是指在纳税人的所得税基础上，继续扣除一定金额的税费，以提高个人收入。它是税务部门特别制定的税负减轻措施，帮助个人缓解税收负担。