水利建设基金计入的会计科目为：预算外水利建设基金（借），政府性基金（贷），出资支出（借），累计支出（贷）；其中出资支出是指对水利建设基金的出资，水利建设基金的会计核算分为两个阶段：入库登记阶段和支出阶段，水利建设基金入库登记时，应当在预算外水利建设基金（借）上增加金额，同时在政府性基金（贷）上减少相应的金额，入库登记完成后，便进入水利建设基金的支出阶段。支出时，应当在出资支出（借）上增加金额，同时在累计支出（贷）上增加相应的金额。 拓展知识：水利建设基金是政府形成的一种特殊的资金，主要用来支持水利设施建设和改建，其会计核算过程一般包括入库登记、支出等，同时，它也会涉及到相应的会计业务处理，考虑到水利建设基金的特殊性，在业务处理和会计核算上应该加以特殊的控制和管理。