当涉及到外贸企业报关单商品编码申报退税率时，应根据相关法律法规和税率发布的有关规定进行申报，并根据发票情况，结合有关规定和税务机关发布的税率表确定具体税率。如果实际情况与发票开具的税率不一致，可能会受到税务机关的处罚，而拒绝入境的进口货物可以申请免税或重新检验。 另外，建议外贸企业在申报报关单时，务必牢记税务法规，正确理解商品税率，确保申报税率准确和可查询。同时应注意税收优惠政策，把握准确时机。此外也要控制企业的进出口总额，以保证企业支付的税收达到最低。