甲公司发行债券会计分录如下： 1. 债务利息支出：应付债券利息（3%）× 5000000元，分摊到每年（实际利率4%计提摊销）； 2. 债权投资：债券发行收入 4861265元； 3. 货币资金：经发行债券筹集的资金； 4. 年末利息摊销的支出：内部支出，4%× 5000000元； 5. 已偿还债务：内部支出，当债券到期时应偿还 5000000元。 拓展知识：实际利率法摊销是指把利息支出按照债务面值和实际利率比例，按照利息支出总额在各期间中的比例摊销到各期间。