小规模农业贸易公司收购农产品时，如果没有发票入账，要想确保正当性，可以采取以下措施： 首先，收购单位应当根据收购数量，签订农产品收购合同，双方签字并且备注，双方应当约定合同条款，指定收购及支付时间，以及制定违约惩罚等，以明确收购事宜。 其次，收购单位应当将收购的农产品存放到专业的仓库或者保管处，并安排专人负责管理。严格按照农产品标准，防止假冒伪劣产品流入市场，并记录库存情况，确保农产品的可靠性。 最后，收购单位要按时收购农产品，及时确认物流状态，及时入账，并记录收购数量及购买费用，及时缴纳税款，确保收购过程合规。 当然，不少农户由于财务素养差，发票及账目保存及档案管理欠佳，这时候可以考虑利用软件进行管理，可以做到统计及分析，提高运营效率。 拓展知识：农业企业，特别是小规模农业贸易企业，可以采取贷款和财政补助等方式实现技术改造，提高生产力和效率，并使用新技术改善财务管理，以提高财务收支账目的准确性。