在增值税发票综合服务平台上进行进项税额部分抵扣的操作方法如下： 首先，登录增值税发票综合服务平台，进入“发票管理”，点击“进项税额抵扣”，在新页面中，点击“报销申请”。 然后，选择需要申报抵扣的发票，点击“下一步”，输入需要抵扣的金额，然后确认，就可以完成部分抵扣的操作。 此外，在增值税发票综合服务平台上还提供其他让企业便捷运营的服务，例如发票查询、发票认证、发票机批量传输、发票分析报表等，可以为企业节省大量的时间和精力，提高企业的效率和经济效益。