对于年底实际未抵扣的进项税额和账上金额对不上的情况，应该细心核实账务处理，查询出具体原因，才能解决这类问题。可以从相关核算凭证、税收管理系统、进项票抵扣发票等资料中查询，总结出未能抵扣应税货物及劳务发票、负数发票等发票问题，以及不符合抵扣条件的抵扣凭证等问题，然后按照税收法律法规的相关规定办理业务，实现抵扣，解决账上金额与实际未抵扣的进项税额对不上的问题。 另外，税务机关联合有关部门，以进项税额核实抵扣的方式，实施税收跟踪管理，既可以督办纳税人平时税收征管行为，又可以加强税收外包服务机构的责任追究，以提高税收征管效能，解决账上金额实际未抵扣进项税额对不上的问题。