首先，关于员工报销发票金额大于应报销金额的处理，具体处理流程是： 1、确定实际报销金额：发票和报销相关信息应该由财务部门或者报销人员进行验证，计算出实际应报销的金额； 2、补齐报销差额：如果发票金额大于实际应报销金额，员工需要补齐差额，处理方式一般是由发票所有人自行缴付； 3、确认报销信息：报销完成后，需要确认报销信息，确保所有发票报销项目和金额分类正确，符合有关报销管理规定； 4、记录报销信息：报销完成后，需要记录报销信息，包括报销人员、报销日期、报销项目、报销金额等，以便以后参考。 以上是关于员工报销发票金额大于应报销金额的处理流程。拓展知识：对于报销过程中存在异议的情况，可以让财务部门或者报销人员提供相关的附件证明或者联系相关部门进行核实，以便处理报销发票金额大于应报销金额的情况。