进出口公司和一般纳税人的区别主要体现在税率、税收基数、抵免等方面。进出口公司作为特殊的经营主体，其所征收的税收结构和一般纳税人有所不同。 首先，税率方面，进出口公司可以享受较低的税率，比如企业所得税、增值税等；而一般纳税人则不具备这种优惠。 其次，税收基础方面，进出口公司的税收基础是根据货物的实际结算金额确定的。而一般纳税人的税收基础是根据发票金额确定的，且发票金额要比实际结算金额高一些，有时会比较明显。 最后，进出口公司在增值税方面可以进行一定抵免，比如一般纳税人在销售增值税时，可以将购买商品前面所产生的增值税进行抵免，以减少税负。而一般纳税人则不享受这样的抵免政策。 拓展知识：除了上述差异以外，进出口公司还可以根据中华人民共和国海关总署的确定的特殊物品，享受一定的减免税收政策。