是的，合作社逾期年报被列入经营异常名单的，不能办理法定代表人变更。因为根据《中华人民共和国企业法》第九十四条的规定：被列入经营异常名单的企业，不得任聘、补任、变更法定代表人。如果没有及时报送年报或者报送财务报表，不符合《审计程序法》关于企业年度审计的要求，对此可能会导致企业被列入经营异常名单，而企业一旦被列入，就不允许变更法定代表人。所以，要想准确判断合作社是否可以变更法定代表人，还需要根据具体情况来考虑，如企业报送年报和财务报表是否按时完成。 拓展知识：在变更法定代表人时，除了必须满足上述要求，还要经过子公司、合伙人开会，由企业法定代表人（或经营者）签字确认，最后向工商行政管理部门提交变更注册的相关资料，才能正式变更法定代表人。