社保只赔付3万，公司要赔付6万，首先应当对公司要赔付的6万进行划转，把它从公司现金账户划转到员工工伤账户，账户名称记为“工伤赔偿金”，做法如下： 1、从公司现金账户划转6万，账户名称记为“应付款”； 2、从“应付款”账户划转到“工伤赔偿金”账户6万； 3、从社保账户转入3万，账户名称记为“社保赔偿金”； 4、从“社保赔偿金”账户划转到“工伤赔偿金”账户3万。 完成以上四个步骤，即可完成社保只赔付3万，公司要赔付6万的工伤账务处理。 拓展知识： 公司制定了工伤费用支付程序，为了减少工伤费用，避免误解，合理利用社会保障资金，节约公司资金，应当严格遵循制定的工伤费用支付程序，不随意发放，并且在发放的过程中做好账务处理，避免对财务会计形成隐患。