员工个人开的公司抬头的电子通行费专票，即使不抵扣勾选也要入账。要入账，首先要先进行收票登记，把发票信息记录到会计凭证中。接着，完成收票登记后，即可进行凭证录入，根据财务记账准则录入正确合法的凭证，完成票据入账。入账完成后，需要进行账务处理，比如结转损益，进行应付账款核销等，这样，在完成账务处理后，就可以完成对个人票据的入账操作。 拓展知识： 在财务会计中，抵扣费用可以减少税负，但是抵扣费用必须在指定的时间内报销才能予以抵扣，因此发票必须做到及时入账，以便及时完成报销，从而得到抵扣作用。