按照《灵活就业人员保险条例》规定，灵活就业人员参加基本医疗保险的社会保险费，应由本人和用人单位等共同缴纳，其中灵活就业人员自付的社会保险金部分，可以通过报销方式进行计算和扣除。因此，灵活就业人员自己缴纳灵活就业医疗保险后，在申请报销时可以使用本人的发票作为报销凭证，由用人单位代替灵活就业人员申请报销。个人发票可以作为用人单位核对灵活就业人员实际缴纳社会保险金的有效凭证，促进灵活就业人员就业的参与度。 拓展知识：灵活就业人员缴纳的社保医疗保险费用，包括本人和单位的共同缴纳。灵活就业人员自行缴纳的部分，需要由单位在申请报销的时候，代替个人进行报销，以保证其可以按时缴纳各项医疗保险费用。