车辆的桥路费专用发票不可以抵扣，无法在系统中进行抵扣处理。首先，可以按照实际损耗金额，采取书面报销或现金报销的方式进行结算，以合理损耗金额进行报销；其次，可以在系统中对桥路费的支出进行特别的注明，以便后期查账，让财务核算数据更易于审核。此外，可以通过前级单位或者桥路费实付单位开具支出证明来取代专用发票，结合财务登记，以便完成财务核算。 拓展知识：桥路费是指专用于支付桥梁过河一次性支出的费用，包括架桥费、桥涵费等，它是河长制落实机制的重要部分，也是治理河道和河水污染防治的基本原则，必须严格按照规定执行，以坚持以“拿资金解决问题”的责任原则。