在处理公司不扣税的员工个税时，首先，需要核算准确的个人收入，详细记录员工收入来源及部分扣除项，如预扣预缴、商业健康保险、住房公积金等，以准确计算个人所得税；其次，应当根据收入征收相应的个人所得税，一般来讲，应当根据专门的计算公式计算，最后，将扣缴的个人所得税记录到账务系统里，以便于了解税务状况。 拓展知识，个税的范围主要有两类：一是薪金薪酬类所得，包括职工工资、奖金、费用补助等；二是商业活动类所得，包括利润分配、财产转让、货物、加工修理修配费用收入等。