留底退税是指企业在完成增值税结转时，因财务账目不全、账目及时性、准确性方面原因，难以完全准确明确增值税纳税义务和应纳税额，因此采用税收优惠措施留底对实际应缴税款低于实际应缴税款的部分退还给企业。 一般情况下，需要查账来确定留底退税情况。在查账时，要全面考核企业做过的增值税申报、财务报告及缴税情况，确认企业实际应缴增值税额，以此来确认企业留底退税情况。 留底退税是税收优惠措施，政府对企业采取有利措施，企业应主动掌握政策，把握机会，减少税收负担，发挥税收优惠的功效，拓展财务筹款渠道，在维持企业正常经营的同时，提高企业成本效益。