是的，可以作废自己在电子税务局代开的增值税发票。发票作废的方法有三种：①实物作废：由发票的开票单位或它的授权代理机构销毁发票纸张；②注销作废：发票方将发票上的抬头、金额、税率等信息清楚地注销，并在空白处签字或盖章，以表示经报废；③电子作废：发票方通过电子发票系统进行作废，将发票的相关信息录入发票系统进行作废标记。自己在电子税务局代开的增值税发票，可以按照电子作废的方式进行作废。 此外，开具发票时应当注意增值税发票的打印技术，一般情况下是打印出一张手持发票，然后再将发票资料按照电子存储的格式存储于电子发票系统，以备税务机关查询票据和在线稽查。发票资料应当与发票纸张上的内容保持同步，以免导致票据不合法。