核心征管系统的增值税未申报和对比，是指将纳税人要扣缴的增值税从政府收入中扣除，由核心征管系统进行未申报和对比。这种未申报和对比包括三个部分：一是计算出的税金额将和实际申报的数据进行对比；二是核心征管系统将进行业务记录的检查，以确认纳税人是否有虚开发票的情况；三是同时将进行符合税收责任原则的审查，以确定每个纳税人是否有重大遗漏。 拓展知识：除了增值税未申报和对比外，核心征管系统还可以进行数据挖掘，收集纳税人具体信息，提高税收负担，以实现政府税收有效管理的目的。