小规模纳税人季度不超过45万的免增值税和疫情新政策开票免税有以下区别： 1、免增值税适用于小规模纳税人，而新政策可以适用于各类纳税人； 2、免增值税是一种持续性政策，而新政策只存在于疫情下； 3、免增值税是以季度不超过45万为纳税人条件，而新政策仅仅是开票免税，没有纳税金额限制； 4、免增值税是只能适用于交易环节，而疫情新政策开票免税既可以适用交易环节，也可以适用于服务行业。 总结来说，小规模纳税人季度不超过45万免增值税和新政策开票免税在适用范围、是否有限制、能否适用服务行业等三方面存在不同。拓展知识：小规模纳税人季度不超过45万免增值税也叫做“小微企业免税政策”，它在2018年新修订的《中华人民共和国会计法》中出现，为小微企业减轻税收负担，改善经济发展环境提供支持。