不需要下载自然人电子税务局扣缴端APP，只需要登录税务局官网或者上级税务局系统，即可完成企业申报员工个人所得税。具体步骤如下：1、首先，在税务局官网或上级税务局系统中登录，进入“企业申报”界面；2、然后，输入企业需要申报的基本信息，如企业名称，信用代码，日期等；3、接着，根据指定的时间段，录入需要申报的员工信息以及个人所得税缴纳金额；4、最后，点击确认申报，即可完成企业员工个人所得税的申报。 拓展知识：企业在申报员工个人所得税时，应当严格按照税务机关规定的格式和要求，填报完整的申报信息、上传相关企业凭证，并遵守相关法律法规，如果有任何违规行为，依法可能会面临罚款、滞纳金等处罚。