企业财务报表修改应充分考虑短期和长期借款。资产负债表是企业确定资产构成和负债来源的依据，通过短期和长期借款，用于融资和购买资产，它将直接反映在资产负债表中，并且借款还款需要支出现金，这将会影响利润表中损益部分的净收入。所以资产负债表和利润表修改需考虑到贷款影响以及贷款的支付时间和金额。纳税申报表的修改应根据现有的报表给出的信息，如利润及其组成、税金等，如果有还款，应根据实际情况进行纳税调整。如果是短期借款没有还款的可以去掉，但必须注意记录下来，便于日后比对审计，确保没有遗漏应纳税额。