汇算清缴完有退税，处理方式如下： 1、将税务机关出具的纳税申报表和发票原件到指定的税务机关处进行复核确认，由税务机关进行汇总统计，确认计算核算后，出具《国家税务局行政处罚决定书》，订立缴款书，准备退税明细账户复核确认，准备退税细项核算表； 2、准备国家税务总局出具的退税票据，经汇总核算确认，向税务机关申请汇算清缴，准备汇算清缴税费申报表，准备手续文件； 3、进行汇总核算，确定待退的税款，打印纳税申报表、汇算清缴税费申报表和汇算清缴结果单； 4、向税务机关报送汇算清缴纳税申报表和汇算清缴税费申报表，提交手续文件； 5、向税务机关申请退税，缴纳汇算清缴应纳税额； 6、税务机关审核确认，准备退税时间表，准备汇算清缴结果单； 7、完成汇算清缴，税务机关审核确认，准备退税凭证，准备退税票据，准备退税表格； 8、由税务机关准备退税凭证，缴纳汇算清缴应退税额，向税务机关报送汇算清缴应退税手续文件； 9、税务机关审核确认，出具《国家税务局税收征收通知书》，准备退税明细帐户，准备退税细项核算表； 10、向税务机关报送退税申请，税务机关核算审核，准备《国家税务局行政处罚决定书》，准备《国家税务总局开票通知书》，准备退税票据； 11、由税务机关开具《国家税务总局退税通知书》，由税务机关确认退税状态，由税务机关向有关当事人发放退税票据，由税务机关出具《国家税务局退税政策批准通知书》，完成退税程序。 拓展知识：为了提高税收征管效能，优化税收管理结构，完善税务行政复议制度，方便纳税人办理相关业务，保护纳税人的合法权益，国家税务总局发布了《汇算清缴管理办法（试行）》，从有效控制税收风险、简化税务程序、提高税务管理效率等方面，对汇算清缴税制度作出明确规定。