根据我国《征收管理法》的规定，当纳税人未在规定的时间内缴纳印花税时，税收机关应当对未缴纳税款根据当地实行的滞纳金率收取滞纳金，并叠加违约金。根据当地实际情况， 5年的印花税5万元，滞纳金，一般按照未缴税款总额的5-10%收取滞纳金，违约金可按照当地规定收取。 拓展知识： 印花税是我国实施的一种特殊的营收税，交纳此税无需申报，只要缴纳就可以，但是如果拖欠或缓缴，有可能会被税务机关进行强制执行，所以，税收机关一旦发现，会严格依法处理，劝缴或强制扣收缴纳滞纳金和违约金。