纳税滞留发票处理一般需要按照规定的期限及税款种类处理，一般来说，首先应该核实发票，确认发票上的税款信息是否完整、填写是否正确、盖章是否有效等；其次，核实发票是否被他人使用过，发票是否已经在纳税系统中认证过；最后，审核发票，确认发票上的纳税信息是否完整无误，如果满足条件，可以把发票放到税务系统中进行认证，完成所有税款的抵扣。 此外，纳税人还要注意，应当及时将滞留发票上传至纳税系统中，以便及时完成纳税登记，避免因税款认证不及时或未认证而导致罚款。同时，当纳税人对发票有异议时，也可以根据规定申请重开发票或者作出其他补偿等处理措施。