总公司和分公司报税一般是分开报税的。在税务机关实施增值税分期缴纳和非居民税收适用优惠办法时，不再划分总公司和分公司，而是统一报税。 工商年检一般是各个分公司各自进行的，每个分公司需要自身报备资料进行工商年检，总公司只负责协调把控。 拓展知识：在企业分支机构管理工作中，总公司除了负责协调把控外，还要定期收集统计和监督检查分支机构的财务报表，及时发现各分支机构的不规范操作，掌握各分支机构的财务状况，从而加强财务管理。