在处理这样的情况时，首先要确定分公司和总公司之间的权责划分，以及财务报表的披露要求。首先要明确，现金这类资产属于总公司，入分公司账户产生的销售款项，需要被计提为分公司的营业收入，另外再准备一张由总公司收款，分公司支付的转账款项凭证，以此作为分公司账户资金向总公司账户资金转账的证据。这样总公司可以收到款项，分公司可以入账收款，两公司的权责划分也完成了，财务报表也更具有完整性。 此外，也可以通过开出客户专用发票的方式，让客户支付款项，然后总公司转账给分公司，这样也可以保障资金的流转，并且完成分公司与总公司之间账务结算的工作。 总之，处理分公司和总公司之间资金流转的问题，无论从账务还是报表等角度出发，都需要规范操作，把转账流程分解为几个步骤，每一步都要做到准确、完善，从而确保总公司和分公司之间资金流转的正常结算。