将公司C调整为A的全资子公司，可以将B公司原有的1000万长期股权投资减少1000万，并将差额全部转入资本公积，可以根据《会计准则》第五十一条关于股权投资的内容来得知，根据会计准则规定，股权投资应当按股权投资在当期所获得的部分折旧和摊销，股权投资持有人发生股权投资减少的，应当将该部分减少的股权投资销售的差额转入资本公积。所以可以将1000万投资减少的差额转入资本公积。 拓展知识：资本公积是从股东的权益中提取出来的，它由股东对公司投资和收益的经济补偿部分形成，按照会计准则第54条规定，资本公积可以向股东支付股利，而且在一定程度上可以减轻股东的存款准备金、应付报酬和现金分红等费用。