答案是肯定的。根据《中国会计准则》及《证券投资收益项目会计处理规定》的规定，投资公司对甲公司拥有乙公司6%的股权的行为应将其计入交易型金融资产，取得的收益也应计入投资收益，若与甲公司约定三年后对方回购股权，不需要缴纳增值税，因为没有实现实物转移，只是价值增值，不存在增值税征税的必要。此外，投资公司还需对购买股权做好相应的发行证券、登记等事宜，确保投资法律合规，以及由此而取得的收益免受诉讼和损失的影响。