是的，当公司分公司独立核算时，只要做汇算清缴，就必须在总公司汇总纳税，填写申报时，应该把所有的数都是总公司加分公司的合计来算，以此来保证税收准确无误。 另外，汇算清缴是指分公司向所在地管理机关申报其上一财务年度所缴纳税款，除结转税款外，其余应纳税款应于申报期内由总公司统一汇总上缴，由本地税务机关核实处理。汇算清缴是为了有效地控制分支机构的纳税行为，防止双重征税，保护纳税人的合法权益。汇算清缴的主要目的是统一实施税收管理，确保税收收支一致，减轻各分支机构的税收负担，防止双重征税。