财务分录的处理方式如下： 1、农业公司发出资金给合作社： 借：应付款 XX元；贷：银行存款XX元； 2、合作社收到农业公司的资金： 借：银行存款XX元；贷：应收款XX元； 3、农业公司收到合作社的银行账户转账： 借：应收款XX元；贷：银行存款XX元。 以上是关于农业公司转专项资金到合作社所应采取的财务分录措施。 拓展知识: 另外，农业公司还可以考虑在向合作社转账之前，先将资金存入担保账户，以防无账款收付纠纷。这样一来，农业公司就可以避免未收到账款的尴尬。此外，在转账时可以采用银行卡转账等进行财务账户的管理，以确保资金的安全性，避免转账过程中的损失。