离职赔偿金超过3倍平均工资的个人所得税应该按照比例进行缴纳，根据税务部门的规定，离职赔偿金超过3倍平均工资部分应属于特定非正常收入，按一般收入进行征收个人所得税。 具体来说，该部分收入应按照国家规定缴纳个人所得税，即20%，个人应当按月在被征收企业处累计缴纳。个人所得税系统是一个省级税务行政机关提供的税务服务系统，该系统可用于企业和个人申报、缴纳个人所得税。企业有专门的个税服务中心，可以根据企业的业务需求，提供申报、发票管理、缴税等个税服务。个人则可以在当地市税务局网站进行个税申报，或者采用网上申报系统进行申报。 拓展知识：《个人所得税法》规定，个人所得税是按照国家规定对个人收入的一种税收形式，其中的征税范围包括工资、薪金，投资收入，经商收入等，一般来说，收入较大的个人应当缴纳个人所得税，并在每月的期末向税务机关申报缴纳个人所得税。