在建筑公司购买苗木抵扣进项账目处理方式如下： 1、首先，将苗木购买支出记录在建筑公司的财务账本上，将支出分类为苗木购买支出。 2、在苗木购买支出的部分，将苗木购买的金额记录在建筑公司的固定资产科目上，这样可以将金额记录在应付发票中。 3、将建筑公司购买的苗木的金额抵扣到每一笔应付发票的金额中去，并给出相应的记录。 由于苗木购买可以作为抵扣应付发票的支出，这样可以避免建筑公司在应付发票完结时反复消费，减少资金流动。 拓展知识：抵扣进项账处理不仅仅限于苗木，还可以用于其他种类的投资支出，如设备购买，在公司购买物资时，也可以抵扣进项账处理。