对于这部分的账务处理，我们需要做出正确的操作，首先应核实提取的实际金额是否与地产公司及建筑公司缴纳的金额一致，若不一致，应核实是否有相关不可抗力因素，若无，则地产公司和建筑公司应分别按照实际应缴纳额补齐。在账务处理上，先安排公司内部资金调拨，地产公司向建筑公司划拨金额，同时建筑公司可向地产公司开出发票，供其向税务机关申报，以免增加流动性的负担。此外，可将农民工保证金的存取作为内部交叉账款进行处理，提高内控审计制度的完善，加强企业之间的合作关系。