环境保护税的计算方法主要有三种：一种是根据环境污染的损失成本来定价的方法；另一种是以政府立法或社会共识为基础收取全额税收的方法；最后一种是基于行为的权利与义务方案（R&D）的方法。首先，据损失成本计算的方法是基于经济学概念，按照一定的规则计算环境损失的损失成本，然后根据定价原则计算出环境保护税的金额。其次，在政府立法或社会共识的基础上，政府设定不同的环境保护税，收取不同的税收。最后，基于行为的权利与义务方案（R&D）的方法旨在激励行为，鼓励用户采取环境友好的行为，比如政府可以为环境友好的行为提供免税政策，激励用户采取环境友好的行为。 拓展知识：近年来，环境保护税的政策正在进一步完善，比如，环境保护税可以根据环境污染的程度进行分类，考虑到地区差异，政府还可以根据不同地区实施差异化的环境保护税政策。在环境保护税的收入上，政府可以通过多种手段征收，例如，政府可以对增值环境产品和服务征收环境税，也可以对污染行业实施更严格的限制性税收。