对于非独立核算分公司，工资根据具体情况有不同的处理方式，一般而言，由总公司发放工资是最常见的，这样更有助于控制成本。总公司发放工资时，也会对每位员工进行相应的个人所得税申报。个人所得税申报将由总公司完成，分公司可以协助统计核算，但最终由总公司来完成。 拓展知识：由于分公司不是独立核算单位，一般情况下没有自己的个税登记，因此要想完成个税申报，分公司的工资发放必须由总公司来发放，这也是为了规范管理和稳定财务状况，以确保企业的正常运转。