对于公司100%投资的那家公司已经注销的情况，是需要长期股权投资需要清理的。因为公司在进行长期股权投资时，把资金投入到另一家公司。当原有投资公司注销时，就会出现被投资公司被注销的情况，长期股权便处于非正常的状态，此时公司就需要进行账上的长期股权投资的清理工作。 对于长期股权投资的清理工作，公司可以通过以下几种方式处理：第一，减少被投资的公司的净资产，确定被投资公司是否有账面价值；第二，取消账上的长期股权投资，把资金从另一家公司转移回来；第三，向被投资公司要求把投资带来的益处通过离职补偿等方式返还。 拓展知识：长期股权投资的报告与清理，是企业应付相关核算要求以及确保投资资金有效节省和投资收益有效管理的重要步骤。为了确保长期股权投资能够及时、准确地进行财务核算，企业应当对账上的长期股权投资进行报告和清理。