总公司在所得税汇算清缴的时候，子公司所获利息部分是不能税前扣除的。因为，根据国家税务总局有关财税政策的规定，税收征管单位只能税后扣除作为利息所有。即在缴纳个人所得税后，按照税收征收管理单位要求，要交纳相关税费，子公司所得利息部分不在此范围。此外，关于利息的所得税收缴，根据有关法律法规的规定，子公司利息收入所得税由总公司来负责缴纳，子公司只需要把利息收入纳入财务费用中即可。拓展知识：企业所得税是企业在各国交税时应缴纳的一项重要税种，主要包括对企业所得的税收征收和管理。