非独立核算分公司的收入应该在总公司财务系统内进行记录。首先，分公司的收入应该从收款账户转入总公司的财务账户，然后再由总公司对收入进行确认，并根据公司的会计准则准备记账凭证，将收入登入总公司的应收账款科目，最后进行记账。如此，总公司将通过收取分公司的收入来记录其财务收入记录。 拓展知识：非独立核算的分公司收入，应该由总公司进行主导，以保证财务的准确性和完整性。对分公司收入的核算，必须严格按照会计准则的规定进行，以避免发生财务问题和数据不准确问题。