企业代扣个税，税务局退回的手续费，做账时需要注意以下几点： 1.首先，要在财务系统中分别录入税务局垫付的代扣个税和退回的手续费，将税务局发给企业的现金进行收款登记，并记入应收税款账户； 2.同时，要在收款登记的辅助核算项中详细记录企业代扣税款和税务局退回的手续费的税种、金额； 3.在税务局垫付的代扣税款明细表中，分别记录企业缴纳的每种税种和税务局垫付的代扣税款，应收和已收的金额； 4.及时录入税收管理信息，记录税务机关收取的税款及企业代扣和退回的税款明细； 5.定期核对账务信息，确保与税务机关的纳税信息一致，准确处理账务核算。 税务局退回的手续费是指企业在缴纳税款时，税务机关为保证税款准确、及时、安全收缴而收取的手续费，在申报纳税时，企业可以增加此类费用的抵扣，以减免税收。此外，也可以把企业支付的手续费用于服务费、管理费等方面，有助于企业降低成本、提高效率。