是的，总公司可以合并申报子公司的企业所得税。一般情况下，子公司的形式是，总公司拥有子公司股份大于50％，控制子公司的股东类型，并参加其治理。总公司可以申报合并企业所得税，但也要注意，这只适用于满足要求的母子关系，即母公司拥有但不控制子公司的大部分股份，同时具备经营控制。另外，为了申报合并企业所得税，双方需要打破地域壁垒，实现应税领域的统一，将母公司和子公司的税收属性归为同一级，以实现多地税收的集中申报和管理。拓展知识：异地的子公司申报合并企业所得税，需要配合国家规定，实行统一纳税，让企业在母子公司多地经营中真正实现企业所得税的统一管理。