是的，自建厂房收到的发票可以抵扣。对于自建厂房，根据国家财政部的规定，在收取国家发放的财政补助资金的情况下，可以抵扣投资经营支出的税款。常见的情况包括厂房建筑及改建、厂房租赁、机器设备租赁、生产劳动等支出。 拓展：自建厂房可以通过增值税专用发票（含抵扣凭证及按导出使用增值税发票）销售、购买等收入扣除进行税负减免，但需注意的是，不同地区可能会有不同的规定，这些都需要具体问政府部门来确认。