1、首先，需要对账目进行认真的核对，确保数据的准确性。对材料的缺失原因进行分析，包括运输过程中的损失、管理人员操作失误等原因，识别出责任单位，并与供应商及负责的部门进行积极沟通，尽量减少经济损失。 2、扣除供应商的款项，应遵循法律法规，按照一定的流程处理，比如通过双方签订补充协议或变更材料价格等，处理完毕后，审批相应的文件，提交相关人员签字，以做到供应商与财务部门等相关部门的同意。 3、同时，可以要求供应商在未来的交易中加强质量管控，规范入库流程，增强对管理责任的贯彻执行、加强商业服务态度。 拓展知识：处理材料盘亏是每个企业必不可少的管理工作，需要做好以下几个方面的工作： （1）建立有序的材料盘点管理机制，严格落实内部质量控制体系，做到材料准入、流程管理、库存调整等； （2）定期对账物资库存进行盘点，及时发现问题，及时予以预防； （3）强化仓储管理，实施仓库标准化建设，建立库存管理体系，提高库存管理的准确性、及时性与有效性； （4）建立有效的质量控制机制，严格执行材料入库管理，定期考核检查相关人员是否规范执行管理制度和操作流程。