汇算清缴里的工资薪金金额必须和个税系统里的金额一样才能准确计算出纳税人的个税，如果实发金额大于个税系统里的金额，就会出现缴纳的个税多于实际应缴的个税的情况。在此情况下，首先应加强对个税系统的管理，正确填报和录入实发金额。其次，可以通过个税信息查询专网查询纳税人缴纳的个人所得税，如果发现差额，需要及时申报税款，补缴多余的部分。 拓展知识：为保证个税准确计算，有些国家还开发了汇算清缴系统，它纳入了企业缴纳职工个人所得税的初始数据，职工的实发工资和职工的个税的准确金额可以实时计算、办理，可以有效解决职工与企业之间因个税差额问题带来的纠纷或纠葛。