一般来说，农民工专用账户余额不够时，应该从总包的账户中转入，相关规定可以从《国家住房和城乡建设部关于印发《农民工工资支付暂行办法》的通知》中找到。文件明确规定，农民工的工资资金应从当地总包负责人提供的专用账户中支付，如果总包账户余额不足，它可以从其他账户转账补足。 拓展知识：根据国家规定，为了保护农民工的合法权益，政府只允许农民工工资支付时使用正规账户，避免用体力劳动人员得不到应有的权益保障。总包账户中需要建立农民工工资管理制度，定期检查账户余额，严格审核工资转账等支付流程，确保每位农民工都能得到及时、准确、足额的工资发放。